利用C0t-1 DNA对高秆野生稻和宽叶野生稻基因组的比较分析

时间:2022-06-24 05:50:14 其他范文 收藏本文 下载本文

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利用C0t-1 DNA对高秆野生稻和宽叶野生稻基因组的比较分析

篇1:利用C0t-1 DNA对高秆野生稻和宽叶野生稻基因组的比较分析

利用C0t-1 DNA对高秆野生稻和宽叶野生稻基因组的比较分析

为了揭示同为CCDD摹因组类型的高秆野生稻和宽叶野生稻的起源和进化关系,用高秆野生稻C0t-1 DNA作为探针,对其自身体细胞染色体与宽叶野生稻体细胞染色体进行荧光原位杂交并对其核型进行同源性聚类和比较分析.杂交结果显示宽叶野生稻和商秆野生稻同源性非常高,说明它们的`亲缘关系十分接近,但区别也非常明显,两者的杂交信号存在显著不同.C0t-1 dNA具有很强的种特异性和依赖基因组型的特异性,利用它进行荧光原位杂交能够更有效地研究物种基因组间的关系,为物种的划分和鉴定提供依据.另外.通过对高秆野生稻和宽叶野生稻两个异源四倍体基因组的中高度重复序列的比较分析,探讨了稻属异源四倍体可能的起源与进化机制.

作 者:王德彬 王阳 赵侯明 李刚 覃瑞 刘虹  作者单位:中南民族大学生命科学学院/生物技术国家民委重点实验室,湖北武汉,430074 刊 名:中国水稻科学  ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE 年,卷(期): 24(2) 分类号:Q943 S511.021 关键词:高秆野生稻   宽叶野生稻   染色体重复序列   荧光原位杂交   核型   基因组   亲缘关系  

篇2:利用GISH和C0t-1DNA-FISH对稻属B,C,G基因组的比较分析

利用GISH和C0t-1DNA-FISH对稻属B,C,G基因组的比较分析

为探究稻属B,C,G基因组之间的关系以及研究中高度重复序列在稻属不同物种基因组进化中的作用,利用药用野生稻和斑点野生稻的中度和高度重序列C0t-1 DNA和总基因组作为探针,对疣粒野生稻进行了比较染色体原位杂交分析.该2种野生稻的总基因组和C0t-1 DNA在疣粒野生稻染色体上信号覆盖率分别为(72.39±0.11) %,(75.60±0.18) %,(47.93±0.16) %,(55.47±0.12) %. 此外,以C0t-1 DNA的杂交信号组成为依据,对疣粒野生稻染色体组进行了核型分析.结果表明:G基因组和B,C基因组之间的'关系都比较远,其原因可能是G基因组要早于B,C基因组从稻属的祖先中发生分化,并在进化过程中发生加倍、重排和基因选择性丢失等现象,形成了各自种的特异基因组成分.稻属基因组中度和高度重复序列与功能基因一样,在不同种中也存在着相当的同源性和保守性,并在进化过程中得以保存下来.药用野生稻和疣粒野生稻基因组增大的重要原因之一,可能是基因组中度和高度重复序列加倍的结果.

作 者:覃瑞 马骞 王德彬 吴绮 Qin Rui Ma Qian Wang Debin Wu Qi  作者单位:中南民族大学,生命科学学院,武汉,430074 刊 名:中南民族大学学报(自然科学版) 英文刊名:JOURNAL OF SOUTH-CENTRAL UNIVERSITY FOR NATIONALITIES(NATURAL SCIENCE EDITION) 年,卷(期): 25(2) 分类号:Q943 关键词:重复序列   核型   信号覆盖率   疣粒野生稻  

篇3:东乡野生稻重复序列的克隆分析及染色体定位

东乡野生稻重复序列的克隆分析及染色体定位

从东乡野生稻(Oryza rufipogon Griff)中克隆到7个重复序列,序列分析表明: 这些序列是与转座因子有关的.序列. 以序列H2为探针,对不同基因组水稻进行Southern杂交,表明该序列为稻属内AA基因组特异的重复序列. 其分布在水稻的多条染色体上,荧光原位杂交(FISH)结果显示该重复序列主要位于染色体的着丝粒以及端粒附近,重复单位序列长度为615 bp左右. 并就特异重复序列在水稻研究中的应用进行了讨论.

作 者:洪义欢 钱凯 秦秋琳 陈建民 HONG Yi-huan QIAN Kai QIN Qiu-lin CHEN Jian-min  作者单位:扬州大学,生物科学与技术学院,江苏,扬州,225009 刊 名:扬州大学学报(农业与生命科学版)  ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF YANGZHOU UNIVERSITY(AGRICULTURAL AND LIFE SCIENCE EDITION) 年,卷(期): 27(3) 分类号:Q343.1+2 S511.9 关键词:东乡野生稻   重复序列   Southern分析   荧光原位杂交  

篇4:栽培稻与普通野生稻BC2F2群体产量相关性状的QTL分析

栽培稻与普通野生稻BC2F2群体产量相关性状的QTL分析

以广陆矮4号(Oryza sativa ssp.indica)为母本及轮回亲本,普通野生稻(Oryza rufipogon)为父本,分单株连续回交2次,构建BC2F2群体.首先用241对具有双亲多态性的SSR标记对BC2F1单株进行代换片段分析,在此基础上,根据BC2F1的表型选产量较优的单株自交获得BC2F2群体,用代换片段上具有双亲杂合型基因型的24对SSR标记进行QTL定位.在所选的BC2F1单株上,共检测到分布于7条染色体上的20个野生稻的.代换片段,平均每条染色体上有2.86个;代换片段长度最小为0.55 cM,最大为33.00 cM,平均长度为12.36 cM,总覆盖长度为247.20 cM,覆盖率为16.21%.利用BC2F2群体对14个产量相关性状进行QTL定位,共检测到控制8个性状的20个QTL.对性状表型值起增效作用的有11个,占总检出数的55%.控制产量相关性状的QTL存在簇状分布现象,这与表型相关分析结果相符合.

作 者:程桂平冯九焕 梁国华 刘向东 李金泉 CHENG Gui-ping FENG Jiu-huan LIANG Guo-hua LIU Xiang-dong LI Jin-quan  作者单位:程桂平,冯九焕,刘向东,李金泉,CHENG Gui-ping,FENG Jiu-huan,LIU Xiang-dong,LI Jin-quan(华南农业大学,广东省植物分子育种重点实验室,广东,广州,510642)

梁国华,LIANG Guo-hua(扬州大学,植物功能基因组学教育部重点实验室,江苏,扬州,225009)

刊 名:中国水稻科学  ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE 年,卷(期):2006 20(5) 分类号:Q943 S511.032 关键词:栽培稻   普通野生稻   BC2F2群体   产量相关性状   数量性状座位  

篇5:覆盖野生稻基因组的染色体片段替换系的构建及其米质相关数量性状基因座位的鉴

覆盖野生稻基因组的染色体片段替换系的构建及其米质相关数量性状基因座位的鉴定

染色体片段替换系(CSSL)是基因组水平快速初步定位数量性状基因座位(QTL)的良好材料,而水稻的品质性状是多基因控制的数量性状,因此可用替换系鉴定控刎制水稻品质性状的QTL.本文用分子标记辅助选择技术(MAS)构建了由133个株系组成的以‘特青'(籼稻品种)为轮回亲本,以海南的一种普通野生稻为供体亲本,覆盖绝大部分野生稻基因组的染色体片段替换系.利用这套替换系,初步定位了控制稻米外观和理化品质性状的`15个QTL,为今后水稻品质性状QTL的克隆以及稻米品质相关性状的改良提供了依据.

作 者:郝伟 金健 孙世勇 朱美珍 林鸿宣 HAO Wei JIN Jian SUN Shi-Yong ZHU Mei-Zhen LIN Hong-Xuan  作者单位:中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室,上海,200032 刊 名:植物生理与分子生物学学报  ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF PLANT PHYSIOLOGY AND MOLECULAR BIOLOGY 年,卷(期):2006 32(3) 分类号:Q94 关键词:水稻   染色体片段替换系(CSSL)   外观品质   理化品质   数量性状基因座位(QTL)  

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