药物研究中蛋白质组学的研究

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药物研究中蛋白质组学的研究

篇1:药物研究中蛋白质组学的研究

1.1蛋白质组学相关概念: 蛋白质组这一概念是1995年由澳大利亚学者[1]最先提出来的,指的在一个特定的时间和空间内,一个基因组、一种细胞组织或一种生物体所表达的全部蛋白质。对蛋白质组相关问题的研究称之为蛋白质组学,主要是在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律。

1.2蛋白质组学相关技术: 经典的蛋白质组学研究技术主要包括四大方面:(1)蛋白质的分离技术;(2)蛋白质鉴定技术;(3)蛋白质相互作用的研究技术;(4)大量数据的分析技术。其中二维凝胶电泳和质谱技术是蛋白分离纯化鉴定的核心技术。近几年随着蛋白质组学的发展,出现了不少新的研究技术和研究思路,如固相化pH梯度胶条、二维差异凝胶电泳、多维色质联用、表面增强激光解析离子化-蛋白质芯片系统,表面等离子共振、同位素亲和标记等技术的发展,不仅优化了普通二维电泳上样量和检测的极限,而且在自动化、特异性和重复性上都有所突破。

2在药物研究中的应用

近年来,随着蛋白质组学的快速发展,蛋白质组学技术在药物研究领域有着越来越多的应用,为高通量、特异性、快速的进行药物相关研究提供了强有力的技术支持。

2.1靶点的发现和确认: 药物靶点是指药物在体内的.作用结合位点,包括基因位点、受体、酶、离子通道、核酸等生物大分子。筛选与确定新的药物作用靶点不仅为揭示药物的作用机理提供了重要信息,而且对新药的开发研制、建立筛选模型、发现先导化合物等也具有重要意义。

Weingarten等用二维电泳和生物质谱联用技术,对调节性T细胞进行了蛋白质组学分析,寻找与其功能相关的蛋白靶点,以期找到用于治疗多发性硬化症等免疫系统疾病的新药物靶点。Hu等对法尼基转移酶抑制剂的抗癌作用机制进行了蛋白质组学研究。他们对药物作用前后的卵巢癌细胞总蛋白进行了双向电泳以及质谱分析,发现热休克蛋白70在药物作用后表达上调,然后利用热休克蛋白抑制剂和酶联免疫吸附分析进行了后续研究,他们进一步发现热休克蛋白70能够对法尼基转移酶导致的癌细胞凋亡起到保护作用,而热休克蛋白70的抑制可能成为卵巢癌治疗的新靶点[2]。

2.2耐药相关机制研究中的应用: 在癌症、感染等疾病的治疗中,抗肿瘤、抗菌以及抗病毒等药物的耐药问题已经成为相关疾病难治疗、易复发的主要原因之一。关于耐药机制的探讨已经成为了抗菌药物领域的研究热点。利用该技术,研究人员已经发现了多种与耐药相关的蛋白,如:磷酸丙糖异构酶、HSP27、Sorcin等可能与胃癌多药耐药相关;线粒体转录因子A、组蛋白H2B、组蛋白H4、核糖体蛋白L3等可能与结肠癌5-氟尿嘧啶耐药相关; Sigma调控因子RpoD和膜孔蛋白F可能与铜绿假单胞菌多重耐药相关等。这些蛋白的鉴定为深入研究药物耐药性产生机制提供了线索,而且对进一步筛选具有潜在价值的抗多重耐药的药物治疗靶点具有参考价值。

2.3临床医药研究中的应用: 近年来,蛋白质组学技术也被广泛应用于临床研究中。蛋白质组学技术高通量、大规模的优势在临床药物研究中得以充分发挥。例如:根据不同病理过程中蛋白质的种类和数量的变化,筛选疾病特异性发生变化的蛋白质,把这些特异的与疾病相关的蛋白质作为生物标志物进行疾病筛查和分期、分型;根据不同治疗、用药阶段蛋白质表达发生变化的情况,筛选病程、药物作用相关的蛋白,利用这些蛋白标志物进行病程分析和用药时机的选择等;根据生物标志物在不同疾病中的变化,从而辨别疾病的性质和进程,对预后进行判断等。Eberini等研究了佐剂关节炎大鼠模型服用非甾体类抗炎药前后血清蛋白质表达图谱的变化,发现不同的药物对血清蛋白质表达水平的影响不同,而且血清蛋白表达水平的变化与炎症参数如关节肿胀等平行。此研究表明,通过研究用药前后蛋白质谱的变化可以判断药物的疗效,进而为临床选择用药及观察疗效提供有力依据。

3展望

蛋白质与蛋白质相互作用,交叉形成复杂的网络系统,是各项生命活动的基础。从先导化合物设计、靶点的寻找与确认,到药物疗效和毒性的评价,最终到临床个体化给药的实现,都是蛋白质组学发挥其技术的舞台。蛋白质组学技术为新药研发提供了新的思路,无疑将对药物研究起到强大的推动作用,将有良好的应用前景。

参考文献

[1]易红,杨轶轩,陈主初,等.应用蛋白质组学技术筛选胃癌耐药相关蛋白质[J].生物化学与生物物理进展, ,33(3):267-76.

[2]乐军,蒋晓飞,梁莉,吕元.蛋白质组学分析多重耐药的铜绿假单胞菌[J].中国抗生素杂志, 2006,31(8): 496-500.

篇2:蛋白质组学技术的研究

蛋白质组学技术的研究

本文讨论了蛋白组学对人体疾病研究的意义.采用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳、激光捕获显微切割、质谱技术等研究方法 .结合数据库和分析软件对实验结果 的分析,探索在蛋白质水平上的作用模式、功能机理、调节、调控,以及蛋白质群组内相互作用.为各种全身疾病的.早期诊断,进展监测,新靶点的确定提供了重要依据.

作 者:欧阳学剑  作者单位:湖北中医药高等专科学校,434020 刊 名:中国中医药现代远程教育 英文刊名:CHINESE MEDICINE MODERN DISTANCE EDUCATION OF CHINA 年,卷(期): 6(11) 分类号:Q5 关键词:蛋白质组学:技术   研究  

篇3:信号转导的功能蛋白质组学研究

信号转导的功能蛋白质组学研究

随着人类基因组图谱的完成、蛋白质组学技术的飞速发展以及用于蛋白质鉴定的生物信息学的不断完善,蛋白质组学研究已经成为鉴定疾病相关标记和治疗靶点的有效工具.根据研究目的'和研究手段的不同,蛋白质组学又分为表达蛋白质、结构蛋白质[1]和功能蛋白质组学[2].表达蛋白质组学研究细胞内表达的蛋白质种类,双向凝胶电泳是主要的研究方法.结构蛋白质组学研究蛋白的结构,核磁共振和X射线是比较常用的研究方法.功能蛋白质组学是以细胞内蛋白的功能为研究目的,研究内容包括蛋白的糖基化、磷酸化及蛋白的相互作用即信号转导通路的研究等.每一部分内容都有不同的研究方法.本文主要讨论信号转导研究中功能蛋白质组学的研究策略.

作 者:王英红 来茂德  作者单位:浙江大学医学院病理学教研室,杭州,310031 刊 名:临床与实验病理学杂志  ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL PATHOLOGY 年,卷(期): 22(4) 分类号:Q5 关键词:信号转导   功能蛋白质组学   双向凝胶电泳  

篇4:蛋白质组学研究的相关技术进展

蛋白质组学研究的相关技术进展

蛋白质组学的特点是采用高分辨率的'蛋白质分离手段,结合高效率的蛋白质鉴定技术,全景式地研究在各种特定情况下的蛋白质谱.本文就蛋白质纰学研究中的双向聚丙烯酰胺凝胶电泳、质谱技术和蛋白质芯片技术的研究进展进行了综述.

作 者:冯雪 王彬 黄占景 沈银柱  作者单位:冯雪,王彬(河北省廊坊师范学院生命科学学院,065000)

黄占景,沈银柱(河北师范大学生命科学学院,石家庄,050016)

刊 名:生物学教学  PKU英文刊名:BIOLOGY TEACHING 年,卷(期): 35(3) 分类号:Q5 关键词:蛋白质组学   双向聚丙烯酰胺凝胶电泳   质谱技术  

篇5:蛋白质组学在昆虫学研究中应用进展

蛋白质组学在昆虫学研究中应用进展

蛋白质组学已成为现代生命科学领域中的`热点之一,在昆虫学研究中也得到了越来越多的应用.本文就其在昆虫学研究中应用的一些新进展作了综述.最后,提出昆虫蛋白质组学研究中存在的问题,并分析了其发展前景.

作 者:方琦 姚洪渭 叶恭银 FANG Qi YAO Hong-wei YE Gong-yin  作者单位:浙江大学,水稻生物学国家重点实验室,昆虫科学研究所,浙江,杭州,310029 刊 名:浙江农业学报  ISTIC PKU英文刊名:ACTA AGRICULTURAE ZHEJIANGENSIS 年,卷(期): 18(6) 分类号:Q966 关键词:蛋白质组学   昆虫学   应用   进展  

篇6:蛋白质组学及其在肿瘤研究中的应用

蛋白质组学及其在肿瘤研究中的应用

简要介绍了蛋白质组学的概念、研究方法及其在肿瘤研究中的.应用.蛋白质组学研究直接定位于蛋白质水平,从整体、动态、定量的角度去研究基因 的功能,是后基因组计划的一个重要组成部分.恶性肿瘤是一种多基因参与的复杂疾病,从蛋 白质整体水平上研究恶性肿瘤将有助于进一步揭示恶性肿瘤的发病机制,发现恶肿瘤特异性的标志物及其药物治疗的靶标.

作 者:李峰 关勇军 陈主初 LI Feng GUAN Yong-jun CHEN Zhu-Chu  作者单位:湖南医科大学肿瘤研究所,长沙 410078 刊 名:生物化学与生物物理进展  ISTIC SCI PKU英文刊名:SHENGWUHUAXUE YU SHENGWUWULI JINZHAN 年,卷(期): 28(2) 分类号:Q71 关键词:蛋白质组学   恶性肿瘤   研究   proteomics   cancer   research  

篇7:差异蛋白质组学在植物研究中的应用

差异蛋白质组学在植物研究中的应用

差异蛋白质组学是蛋白质组学的研究策略之一,主要目标是研究有意义的因素引起的'蛋白质组成的变化以发现有差异的蛋白质.介绍了差异蛋白质组学应用于植物研究中的基本方法和新兴技术.植物样品制备方法主要为TCA/丙酮法和植物组织分级提取法.2-DE仍是目前主要的分离方法,多维液相色谱等新型分离模式可以弥补2-DE的不足,新型质谱和蛋白质芯片技术的应用可大大提高差异蛋白质的鉴定速度.差异蛋白质组学目前在植物生理、植物组织器官和亚细胞、植物突变体、植物遗传多样性等多方面研究中都有应用.

作 者:刘卫群 李浩  作者单位:刘卫群(河南农业大学农学院,河南,郑州,450002)

李浩(河南农业大学生命科学学院,河南,郑州,450002)

刊 名:安徽农业科学  ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES 年,卷(期):2006 34(17) 分类号:Q753 关键词:蛋白质组   植物   差异蛋白   应用  

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