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篇1:信号转导的功能蛋白质组学研究
信号转导的功能蛋白质组学研究
随着人类基因组图谱的完成、蛋白质组学技术的飞速发展以及用于蛋白质鉴定的生物信息学的不断完善,蛋白质组学研究已经成为鉴定疾病相关标记和治疗靶点的有效工具.根据研究目的'和研究手段的不同,蛋白质组学又分为表达蛋白质、结构蛋白质[1]和功能蛋白质组学[2].表达蛋白质组学研究细胞内表达的蛋白质种类,双向凝胶电泳是主要的研究方法.结构蛋白质组学研究蛋白的结构,核磁共振和X射线是比较常用的研究方法.功能蛋白质组学是以细胞内蛋白的功能为研究目的,研究内容包括蛋白的糖基化、磷酸化及蛋白的相互作用即信号转导通路的研究等.每一部分内容都有不同的研究方法.本文主要讨论信号转导研究中功能蛋白质组学的研究策略.
作 者:王英红 来茂德 作者单位:浙江大学医学院病理学教研室,杭州,310031 刊 名:临床与实验病理学杂志 ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF CLINICAL AND EXPERIMENTAL PATHOLOGY 年,卷(期): 22(4) 分类号:Q5 关键词:信号转导 功能蛋白质组学 双向凝胶电泳篇2:蛋白质功能研究方法及技术
蛋白质功能研究方法及技术
随着后基因时代的到来,蛋白质功能研究已经成为蛋白质组学研究的核心内容,是生物科学极具挑战的领域之一.近年来虽已有大量文章涉及某些蛋白质功能方面的研究,但对蛋白质功能研究方法方面进行系统综述的'文章非常少,因此,从差异蛋白的筛选鉴定、蛋白质相互作用、蛋白质亚细胞定位、蛋白质表达改变的分子遗传学手段(如RNAi)、生物信息学等方面对目前蛋白质功能研究方法和技术及其最新研究进展进行综述,研究者可根据不同的蛋白和实验需要选择适宜的方法.
作 者:蒋英芝 贺连华 刘建军 Jiang Yingzhi He Lianhua Liu Jianjun 作者单位:蒋英芝,Jiang Yingzhi(深圳市疾病预防控制中心,深圳518020;湖南师范大学医学院,长沙410006)贺连华,刘建军,He Lianhua,Liu Jianjun(深圳市疾病预防控制中心,深圳,518020)
刊 名:生物技术通报 PKU英文刊名:BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年,卷(期): “”(9) 分类号: 关键词:蛋白质功能 蛋白质组学 亚细胞定位 蛋白质相互作用 RNA干扰篇3:蛋白质组学技术的研究
蛋白质组学技术的研究
本文讨论了蛋白组学对人体疾病研究的意义.采用双向聚丙烯酰胺凝胶电泳、激光捕获显微切割、质谱技术等研究方法 .结合数据库和分析软件对实验结果 的分析,探索在蛋白质水平上的作用模式、功能机理、调节、调控,以及蛋白质群组内相互作用.为各种全身疾病的.早期诊断,进展监测,新靶点的确定提供了重要依据.
作 者:欧阳学剑 作者单位:湖北中医药高等专科学校,434020 刊 名:中国中医药现代远程教育 英文刊名:CHINESE MEDICINE MODERN DISTANCE EDUCATION OF CHINA 年,卷(期): 6(11) 分类号:Q5 关键词:蛋白质组学:技术 研究篇4:蛋白质的功能
1、运输蛋白:参与物质运输的功能,能使物质在细胞和生物体内自由、准确地转移。主要为各种载体、血红蛋白等。
2、催化蛋白:催化特定的生化反应,降低反应的活化能,使反应快速高效地进行。主要为各种酶类。
3、免疫蛋白:参与免疫应答反应,能使生物体有效地抵御有害生物或物质的入侵。主要为各种抗体等。
篇5:蛋白质组研究进展
蛋白质组研究进展
蛋白质组研究技术是后基因组时代的重要研究手段.综述了流感嗜血杆菌、细菌、酵母、线虫、果蝇蛋白质组的`研究进展以及蛋白质组研究技术在人类疾病研究中的应用.
作 者:胡志远 贺福初 HU Zhi-Yuan HE Fu-Chu 作者单位:北京放射医学研究所,北京,100850 刊 名:生物化学与生物物理进展 ISTIC SCI PKU英文刊名:PROGRESS IN BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS 年,卷(期): 26(3) 分类号:Q7 关键词:蛋白质组 双向电泳 数据库篇6:蛋白质组学研究的相关技术进展
蛋白质组学研究的相关技术进展
蛋白质组学的特点是采用高分辨率的'蛋白质分离手段,结合高效率的蛋白质鉴定技术,全景式地研究在各种特定情况下的蛋白质谱.本文就蛋白质纰学研究中的双向聚丙烯酰胺凝胶电泳、质谱技术和蛋白质芯片技术的研究进展进行了综述.
作 者:冯雪 王彬 黄占景 沈银柱 作者单位:冯雪,王彬(河北省廊坊师范学院生命科学学院,065000)黄占景,沈银柱(河北师范大学生命科学学院,石家庄,050016)
刊 名:生物学教学 PKU英文刊名:BIOLOGY TEACHING 年,卷(期): 35(3) 分类号:Q5 关键词:蛋白质组学 双向聚丙烯酰胺凝胶电泳 质谱技术篇7:药物研究中蛋白质组学的研究
1.1蛋白质组学相关概念: 蛋白质组这一概念是1995年由澳大利亚学者[1]最先提出来的,指的在一个特定的时间和空间内,一个基因组、一种细胞组织或一种生物体所表达的全部蛋白质。对蛋白质组相关问题的研究称之为蛋白质组学,主要是在整体水平上研究细胞内蛋白质的组成及其活动规律。
1.2蛋白质组学相关技术: 经典的蛋白质组学研究技术主要包括四大方面:(1)蛋白质的分离技术;(2)蛋白质鉴定技术;(3)蛋白质相互作用的研究技术;(4)大量数据的分析技术。其中二维凝胶电泳和质谱技术是蛋白分离纯化鉴定的核心技术。近几年随着蛋白质组学的发展,出现了不少新的研究技术和研究思路,如固相化pH梯度胶条、二维差异凝胶电泳、多维色质联用、表面增强激光解析离子化-蛋白质芯片系统,表面等离子共振、同位素亲和标记等技术的发展,不仅优化了普通二维电泳上样量和检测的极限,而且在自动化、特异性和重复性上都有所突破。
2在药物研究中的应用
近年来,随着蛋白质组学的快速发展,蛋白质组学技术在药物研究领域有着越来越多的应用,为高通量、特异性、快速的进行药物相关研究提供了强有力的技术支持。
2.1靶点的发现和确认: 药物靶点是指药物在体内的.作用结合位点,包括基因位点、受体、酶、离子通道、核酸等生物大分子。筛选与确定新的药物作用靶点不仅为揭示药物的作用机理提供了重要信息,而且对新药的开发研制、建立筛选模型、发现先导化合物等也具有重要意义。
Weingarten等用二维电泳和生物质谱联用技术,对调节性T细胞进行了蛋白质组学分析,寻找与其功能相关的蛋白靶点,以期找到用于治疗多发性硬化症等免疫系统疾病的新药物靶点。Hu等对法尼基转移酶抑制剂的抗癌作用机制进行了蛋白质组学研究。他们对药物作用前后的卵巢癌细胞总蛋白进行了双向电泳以及质谱分析,发现热休克蛋白70在药物作用后表达上调,然后利用热休克蛋白抑制剂和酶联免疫吸附分析进行了后续研究,他们进一步发现热休克蛋白70能够对法尼基转移酶导致的癌细胞凋亡起到保护作用,而热休克蛋白70的抑制可能成为卵巢癌治疗的新靶点[2]。
2.2耐药相关机制研究中的应用: 在癌症、感染等疾病的治疗中,抗肿瘤、抗菌以及抗病毒等药物的耐药问题已经成为相关疾病难治疗、易复发的主要原因之一。关于耐药机制的探讨已经成为了抗菌药物领域的研究热点。利用该技术,研究人员已经发现了多种与耐药相关的蛋白,如:磷酸丙糖异构酶、HSP27、Sorcin等可能与胃癌多药耐药相关;线粒体转录因子A、组蛋白H2B、组蛋白H4、核糖体蛋白L3等可能与结肠癌5-氟尿嘧啶耐药相关; Sigma调控因子RpoD和膜孔蛋白F可能与铜绿假单胞菌多重耐药相关等。这些蛋白的鉴定为深入研究药物耐药性产生机制提供了线索,而且对进一步筛选具有潜在价值的抗多重耐药的药物治疗靶点具有参考价值。
2.3临床医药研究中的应用: 近年来,蛋白质组学技术也被广泛应用于临床研究中。蛋白质组学技术高通量、大规模的优势在临床药物研究中得以充分发挥。例如:根据不同病理过程中蛋白质的种类和数量的变化,筛选疾病特异性发生变化的蛋白质,把这些特异的与疾病相关的蛋白质作为生物标志物进行疾病筛查和分期、分型;根据不同治疗、用药阶段蛋白质表达发生变化的情况,筛选病程、药物作用相关的蛋白,利用这些蛋白标志物进行病程分析和用药时机的选择等;根据生物标志物在不同疾病中的变化,从而辨别疾病的性质和进程,对预后进行判断等。Eberini等研究了佐剂关节炎大鼠模型服用非甾体类抗炎药前后血清蛋白质表达图谱的变化,发现不同的药物对血清蛋白质表达水平的影响不同,而且血清蛋白表达水平的变化与炎症参数如关节肿胀等平行。此研究表明,通过研究用药前后蛋白质谱的变化可以判断药物的疗效,进而为临床选择用药及观察疗效提供有力依据。
3展望
蛋白质与蛋白质相互作用,交叉形成复杂的网络系统,是各项生命活动的基础。从先导化合物设计、靶点的寻找与确认,到药物疗效和毒性的评价,最终到临床个体化给药的实现,都是蛋白质组学发挥其技术的舞台。蛋白质组学技术为新药研发提供了新的思路,无疑将对药物研究起到强大的推动作用,将有良好的应用前景。
参考文献
[1]易红,杨轶轩,陈主初,等.应用蛋白质组学技术筛选胃癌耐药相关蛋白质[J].生物化学与生物物理进展, ,33(3):267-76.
[2]乐军,蒋晓飞,梁莉,吕元.蛋白质组学分析多重耐药的铜绿假单胞菌[J].中国抗生素杂志, 2006,31(8): 496-500.
篇8:小麦胚休眠中ABA信号转导的蛋白质组分析
小麦胚休眠中ABA信号转导的蛋白质组分析
利用ABA处理休眠和不休眠小麦品种的胚,并通过双向电泳-质谱技术,比较其蛋白质表达情况.结果发现,共有18个ABA反应型蛋白点的表达存在显著差异.经MALDI-TOF-MS检测及肽指纹图谱(PMF)分析,其中16个蛋白点在有关数据库中得到了归属鉴定.进一步对这16个蛋白及其特性进行综合分析,认为其涉及不同的反应途径,如胁迫反应(冷调蛋白、热激蛋白和醛脱氢酶)、信号交互反应(生长素反应蛋白、乙烯感应因子、钙依赖的蛋白激酶CP4和乙烯反应蛋白),以及种子的基本发育过程(LEA蛋白、Em蛋白、bZIP转录因子、锌指蛋白、myb家系转录因子、淀粉合成酶和纤维素酶等).另外还有2个是功能未知的蛋白,其中之一在已测序的水稻中具有全长的cDNA;另一个经ESI-MS/MS检测,认为是ABA信号转导系统中的一个新组分.对上述2个蛋白分别从籽粒发育不同阶段、不同浓度ABA处理,以及休眠中和打破休眠后这2种状态下不同温育时间等方面来验证其表达与休眠性状之间的关系,结果发现它们在籽粒发育中后期大量合成,与胚休眠性获得的时间是一致的.用同样浓度的ABA处理,这2个蛋白在休眠胚中更易于表达,而在打破休眠的胚中需要5倍的'ABA浓度才能得到相同的表达效果;在用无菌水浸润期间,休眠胚中该蛋白表达水平下降的速率迟于后熟胚中,且随着休眠的打破,该蛋白也消失了.推测其表达可能与休眠性的获得与解除有关.对控制该蛋白表达的基因进行克隆与功能鉴定可能为小麦抗穗发芽育种提供候选位点.
作 者:张海萍 常成 肖世和 ZHANG Hai-Ping CHANG Cheng XIAO Shi-He 作者单位:中国农业科学院作物科学研究所,北京,100081 刊 名:作物学报 ISTIC PKU英文刊名:ACTA AGRONOMICA SINICA 年,卷(期):2006 32(5) 分类号:S5 关键词:小麦 胚 种子休眠性 ABA信号转导 蛋白质组篇9:蛋白质的六大功能
一、免疫系统的构建
蛋白质是构成机体免疫防御功能的物质基础,与免疫系统的组织发生、器官发育有着密切关系。
二、维持正常的新陈代谢
人体的细胞、组织是会代谢更新的。如果蛋白质缺乏,细胞组织不能及时的分化代谢,皮肤就会变得暗黄、无光泽。
三、提供特殊氨基酸
蛋白质的基本组成单位是氨基酸,与人体有关的氨基酸有20多种,其中有8种是人体不能合成的,必须从含有蛋白质的'食物中摄取,被称之为必需氨基酸。
四、提供脂肪储备能量
蛋白质也可以通过脱氨,将无氮的部分转化为身体的脂肪,作为能量储备以供应能量来源减少的时候的使用。
五、重要物资的转运工
人体内酸碱平衡的维持、水分正常的分布、遗传信息的传达和许多重要物质的转运都与蛋白质有关。
六、输送能源
蛋白质作为能源,在人体进行新陈代谢的过程中,旧的组织不断破坏分解,蛋白质可以氧化成产生部分能量。
篇10:林木蛋白质组学研究进展
林木蛋白质组学研究进展
近年来,应用新的基因组学技术来研究林木生长发育以及林木对生物与非生物胁迫的反应已使得人们对林木生物学有了较多的.了解.蛋白质组学是林木生物学的重要内容.综述了林木蛋白质组学在群体遗传、遗传作图、逆境生理、组织器官以及木材形成等方面的研究进展,并简要介绍了林木蛋白质组数据库.最后展望了林木蛋白质组学的发展前景.
作 者:袁坤 王明庥 黄敏仁 YUAN Kun WANG Ming-xiu HUANG Min-ren 作者单位:南京林业大学林木遗传和基因工程重点实验室,南京,210037 刊 名:中国生物工程杂志 ISTIC PKU英文刊名:CHINA BIOTECHNOLOGY 年,卷(期):2006 26(6) 分类号:Q816 关键词:林木 蛋白质组学 逆境生理 木材形成 数据库★ 写作毕业论文
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