鉴定水稻品种的微卫星标记筛选

时间:2022-05-08 12:47:30 其他范文 收藏本文 下载本文

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鉴定水稻品种的微卫星标记筛选

篇1:鉴定水稻品种的微卫星标记筛选

鉴定水稻品种的微卫星标记筛选

选用58个水稻微卫星标记,对目前应用较广的28份杂交水稻亲本材料进行多态性分析,并比较了其中14个标记应用3.0%琼脂糖凝胶电泳和6.0%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳的检测结果.研究表明,所应用的标记可将所有供试水稻材料区分开,不同标记的多态性检测能力差异较大;两种检测方法所得结果高度一致,但非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分辨率较高、带型清晰,能更准确反映水稻材料间的差异.对于一般水稻材料而言,选用12个标记可将不同材料区别开的几率大于99.9%,但要区分遗传相似性较高的.材料,则可能需挑选高多态性标记和(或)增加检测的标记数.

作 者:施勇烽 应杰政 王磊 朱智伟 庄杰云 SHI Yong-feng YING Jie-zheng WANG Lei ZHU Zhi-Wei ZHUANG Jie-yun  作者单位:施勇烽,朱智伟,SHI Yong-feng,ZHU Zhi-Wei(中国水稻研究所,农业部稻米及制品质量监督检验测试中心,浙江,杭州,310006)

应杰政,庄杰云,YING Jie-zheng,ZHUANG Jie-yun(中国水稻研究所,国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室,浙江,杭州,310006)

王磊,WANG Lei(中国水稻研究所科技信息中心,浙江,杭州,310006)

刊 名:中国水稻科学  ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE 年,卷(期): 19(3) 分类号:Q943 S323 S511.024 关键词:水稻   微卫星标记   非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳   琼脂糖凝胶电泳   品种鉴定  

篇2:应用微卫星标记评估我国水稻主栽品种的一致性

应用微卫星标记评估我国水稻主栽品种的一致性

为较准确地评估我国水稻主栽品种的一致性,挑选5个微卫星标记,对41个有2~7个来源的水稻品种进行了微卫星标记检测.结果表明,18个(43.90%)品种存在同一品种名称不同来源间的差异.进一步选择11个代表性水稻品种或杂交稻组合作较大样本分析(50个单株),它们在5个微卫星标记上的.不一致率为0.0%~10.0%,平均为1.67%,每个微卫星标记的异质率变化幅度为0.36%~5.45%.11个品种中有6个(54.55%)在所有位点上完全一致,不一致率通常都不超过5% .因此,在构建水稻品种微卫星数据库时,必须慎重选择取样来源.当鉴别特定材料时,则应相应增加标记数.

作 者:应杰政 施勇烽 庄杰云 薛庆中 YING Jie-zheng SHI Yong-feng ZHUANG Jie-yun XUE Qing-zhong  作者单位:应杰政,YING Jie-zheng(浙江大学 农业与生物技术学院 农学系,浙江 杭州 310029;中国水稻研究所 国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室,浙江 杭州 310006)

施勇烽,庄杰云,SHI Yong-feng,ZHUANG Jie-yun(中国水稻研究所 国家水稻改良中心/水稻生物学国家重点实验室,浙江 杭州 310006)

薛庆中,XUE Qing-zhong(浙江大学 农业与生物技术学院 农学系,浙江 杭州 310029)

刊 名:中国水稻科学  ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE 年,卷(期): 20(4) 分类号:Q943 S511.02 关键词:水稻   微卫星标记   一致性   品种保护   品种鉴定  

篇3:直播水稻最适宜品种(系)筛选及推广应用

直播水稻最适宜品种(系)筛选及推广应用

直播水稻具有省工、节本、节水等优点,是一种农民自发种植的`新型栽培方式,具有广阔的推广前景.近年来我县直播稻种植面积直线上升,针对这一实情,通过种植不同的水稻品种(系),筛选出适宜本县种植的直播水稻品种,为指导全县直播稻大面积种植提供依据.

作 者:刘学进 徐宝玉 沙金红  作者单位:江苏省建湖县农业科学研究所,224700 刊 名:上海农业科技 英文刊名:SHANGHAI AGRICULTURAL SCIENCE AND TECHNOLOGY 年,卷(期): “”(2) 分类号:S5 关键词: 

篇4:利用微卫星标记分析6个山羊品种遗传多样性

利用微卫星标记分析6个山羊品种遗传多样性

利用微卫星标记技术,分析了山西黎城大青羊、吕梁黑山羊、阳城白山羊、新疆南疆山羊、新疆北疆山羊以及宁夏中卫山羊6个地方山羊品种的分子水平上的.遗传多样性,结果表明:19个微卫星位点均为中度和高度多态位点,平均多态信息含量(PIC)达0.6859~0.7083;6个品种平均位点杂合度在0.3832~0.4277之间.遗传分化系数表明:BM203、BM023、BMS6526和BM875 4个位点的遗传分化系数(GST)估算值较大,分别为0.0475、0.0491、0.0107和0.0262,BM3033值最小,为0,表明前4个位点在不同品种间的基因分化占总群杂合度的4.75%、4.91%、1.07%和2.6%;其它位点遗传分化系数(GST)值不高,遗传变异主要存在于各个品种内,品种间遗传变异不大.以Nei氏标准遗传距离的UPGMA和N-J聚类结果表明,吕梁黑山羊与阳城白山羊具有较近的亲缘关系,黎城大青羊与新疆南疆山羊具有较近的亲缘关系;以共祖距离的UPGMA和N-J聚类结果,阳城白山羊与新疆南疆山羊亲缘关系较近,山西地方山羊与新疆山羊有可能存在一定的基因交流.

作 者:张爱玲 马月辉 李宏滨 关伟军 浦亚斌 张英汉 陈宏 赵倩君 何晓红 ZHANG Ai-Ling MA Yue-Hui LI Hong-Bin GUAN Wei-jun PU Ya-Bin ZHANG Ying-Han CHEN Hong ZHAO Qian-Jun HE Xiao-Hong  作者单位:张爱玲,ZHANG Ai-Ling(中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094;西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)

马月辉,李宏滨,关伟军,浦亚斌,赵倩君,何晓红,MA Yue-Hui,LI Hong-Bin,GUAN Wei-jun,PU Ya-Bin,ZHAO Qian-Jun,HE Xiao-Hong(中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094)

张英汉,陈宏,ZHANG Ying-Han,CHEN Hong(西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)

刊 名:农业生物技术学报  ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF AGRICULTURAL BIOTECHNOLOGY 年,卷(期): 14(1) 分类号:S181 S188 关键词:山羊   微卫星   遗传多样性   系统发生   遗传分化系数  

篇5:六个中国固有绵羊品种遗传关系的微卫星标记分析

六个中国固有绵羊品种遗传关系的微卫星标记分析

用5对微卫星引物对哈萨克羊、蒙古羊、兰州大尾羊、同羊、大尾寒羊、小尾寒羊共6个中国固有绵羊品种基因组进行了扩增,对扩增结果用7种聚类方法(欧氏距离、欧氏平方距离、夹角余弦、皮尔逊相关、车贝雪夫距离、街区距离、明考夫斯基距离)进行了分析.结果表明,分布在我国西北部的绵羊品种哈萨克羊、蒙古羊、兰州大尾羊在大多数情况下总是先聚在一起,相对分布于中原地带的同羊、小尾寒羊和西北部的3个品种间距离较远;同羊和小尾寒羊之间距离也很远;大尾寒羊和小尾寒羊之间没有明显的遗传关系,此结果与<中国绵羊品种志>中记载的'情况基本一致.同时,本研究结果也说明7种聚类方法均适用于微卫星标记资料的遗传分析.

作 者:雷雪芹 徐廷生 陈玉林 陈宏 袁志发 LEI Xue-Qin XU Ting-Sheng CHEN Yu-Lin CHEN Hong YUAN Zhi-Fa  作者单位:雷雪芹,LEI Xue-Qin(河南科技大学动物科技学院,洛阳,471003;西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)

徐廷生,XU Ting-Sheng(河南科技大学动物科技学院,洛阳,471003)

陈玉林,袁志发,CHEN Yu-Lin,YUAN Zhi-Fa(西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100)

陈宏,CHEN Hong(西北农林科技大学动物科技学院,杨凌,712100;徐州师范大学生物技术研究所,徐州,221009)

刊 名:中国生物化学与分子生物学报  ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY 年,卷(期):2006 22(1) 分类号:Q343 关键词:绵羊   微卫星标记   聚类分析   遗传关系  

篇6:利用微卫星标记分析7品种(类群)小型猪的遗传多样性

利用微卫星标记分析7品种(类群)小型猪的遗传多样性

采用世界粮农组织(FAO)和国际动物遗传学会(ISAG)推荐的27个微卫星,对久仰香猪、剑白香猪、从江香猪、环江香猪、黑香猪(贵州省种猪场)、五指山猪和滇南小耳猪等我国7个小型猪种(类群)及杜洛克、长白和大白等3个外来猪种的群内遗传变异性和群间遗传差异进行了分析.结果表明,7个小型猪品种(类群)均有较高的群内遗传变异,但久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群的群内遗传变异(平均多态信息含量(PIC)为0.61~0.64)显著低于其他3个小型猪种(平均PIC为0.80~0.84).久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群彼此间的`遗传差异较小(奈氏标准遗传距离为0.12~0.22),但它们与其他3个小型猪种有较大的遗传差异(奈氏标准遗传距离为1.61~1 96),与3个外来猪种的遗传差异更大(奈氏标准遗传距离为1.97~3.30).通过聚类分析,可将这些猪种清晰地分为3大类,久仰、剑白、从江和环江4个香猪类群紧密地聚为一类,其他3个小型猪种聚为一类,3个外来猪种聚为另一类.这一结果基本符合这些猪种的地理分布和品种来源.

作 者:姚绍宽 张勤 孙飞舟 刘培琼 YAO Shao-Kuan ZHANG Qin SUN Fei-Zhou LIU Pei-Qiong  作者单位:姚绍宽,刘培琼,YAO Shao-Kuan,LIU Pei-Qiong(贵州大学动物科学学院,贵阳,550025)

张勤,ZHANG Qin(中国农业大学动物科技学院,北京,100094)

孙飞舟,SUN Fei-Zhou(全国畜牧兽医总站畜禽牧草种质保存利用中心,北京,100094)

刊 名:遗传  ISTIC PKU英文刊名:HEREDITAS(BEIJING) 年,卷(期): 28(4) 分类号:Q953 关键词:小型猪   遗传多样性   微卫星标记  

篇7:氮高效水稻基因型鉴定与筛选方法的研究

氮高效水稻基因型鉴定与筛选方法的研究

采用掺沙土培法,以10个氮效率存在显著差异的水稻基因型为材料,分析了6个氮水平下水稻拔节期、孕穗期、抽穗期和成熟期的氮吸收效率(NAE)、氮利用效率(NUE)和氮收获指数(NHI)的基因型差异,建立了氮高效水稻基因型鉴定与筛选的方法.结果表明,水稻NAE随氮水平增加先升后降,以中氮(0.177 g/kg,以纯N计)为最高;水稻NUE和NHI随氮水平增加而下降.水稻NAE随生育期推进而上升,水稻NUE的'大小则为拔节期>抽穗期>成熟期>孕穗期.基因型和氮水平对水稻NAE、NUE和NHI的影响达极显著水平,以氮水平影响最大,基因型次之.基因型×氮水平互作对NAE和NUE的影响达极显著水平,而对NHI无显著影响.NAE和NUE的基因型差异均以拔节期最大,这一时期为水稻高NAE和NUE基因型鉴定与筛选的最佳时期.土培盆栽下,水稻高NAE、NUE和NHI鉴定与筛选的最适土壤有效氮含量分别为0.157 g/kg(拔节期)、低氮(拔节期)和0.277 g/kg(成熟期).

作 者:程建峰 蒋海燕 刘宜柏 戴廷波 曹卫星  作者单位:程建峰,蒋海燕,刘宜柏(江西农业大学教育部作物生理生态与遗传育种重点实验室,江西南昌,330045)

戴廷波,曹卫星(南京农业大学农业部作物生长调控重点开放实验室,江苏南京,210095)

刊 名:中国水稻科学  ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF RICE SCIENCE 年,卷(期):2010 24(2) 分类号:Q945.1 S511.01 关键词:水稻   基因型   氮效率   鉴定   筛选  

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