基于nrDNA ITS 序列数据的兰属系统发育关系的初步分析（通用9篇）由网友“实际误读机”投稿提供，今天小编在这给大家整理过的基于nrDNA ITS 序列数据的兰属系统发育关系的初步分析，我们一起来看看吧！
篇1：基于nrDNA ITS 序列数据的兰属系统发育关系的初步分析
基于nrDNA ITS 序列数据的兰属系统发育关系的初步分析
现存的兰属分类系统是基于宏观形态学性状、尤其是花粉块的数目以及唇瓣与蕊柱的愈合程度而建立的.兰属因此而划分为3个亚属:兰亚属 (subgenus Cymbidium),大花亚属(subgenus Cyperorchis) 和建兰亚属 (subgenus Jensoa).本文运用PCR扩增和直接测序的方法分析兰属 (Cymbidium) 27种、3个栽培品种以及3个外类群的核DNA ITS 区段序列.通过最简约性分析产生的ITS系统发育树表明,兰属的3个亚属均可能为不自然的类群.大花亚属表现为一复系群,兰亚属的冬凤兰 (C.dayanum) 隐藏于其中;建兰亚属为一并系群,它的成员之一兔耳兰 (C.lancifolium) 偏离出去而成为兰属一最基部的分支;兰亚属为一复系群,它分为几支而分别与另两个亚属组合在一起.由于兰属ITS序列位点变异率较低,最简约性分析产生的几支主要分支均得不到Bootstrap分析的`高度支持,各亚属内组之间的关系也不明确.研究兰属的系统发育关系还需要新的数据.
作 者：张明永 孙彩云 郝刚 叶秀 梁承邺 朱光华 作者单位：张明永,孙彩云,郝刚,叶秀,梁承邺(中国科学院华南植物研究所,广州,510650)朱光华(密苏里植物园,圣*路易斯,MO,63166-0299,美国)
刊 名：植物学报 ISTIC SCI英文刊名：ACTA BOTANICA SINICA 年，卷(期)： 44(5) 分类号：Q941+.2 Q949.71+8.43 关键词：兰属 兰科 系统发育 ITS Cymbidium Orchidaceae phylogeny ITS篇2：依据ITS rDNA序列探讨我国盾腹虫属种类的系统发育关系
依据ITS rDNA序列探讨我国盾腹虫属种类的系统发育关系
盾腹吸虫为寄生扁形动物中一小的类群.我国已报道7种盾腹吸虫,其中5种隶属于盾腹虫属(Aspidogastridae,Aspidogastrinae).研究测定了在我国采集到的'4种盾腹虫属吸虫的核糖体DNA转录内间隔区(ITS rDNA)序列,并分别采用邻接法和最大似然法构建分子系统发育树.结果显示,这4种盾腹吸虫的ITS-1和ITS-2序列的长度分别在728-877 bp和518-645 bp之间,其G+C含量分别在50.1%-52.3%和49.2%-52.2%范围内.4种盾腹吸虫的种间遗传距离在0.2%-26.9%之间,其中重庆盾腹吸虫(Aspidogaster chongqingensis)和似螺盾腹吸虫(A.limacoides)间仅为0.2%.所构建的最大似然树和邻接树具有相同的拓扑结构,均支持重庆盾腹吸虫和似螺盾腹吸虫亲缘关系最近,它们与饭岛盾腹吸虫(A.ijimai)亲缘关系较近,而与位于系统树基部的贝居盾腹吸虫(A.conchicola)关系较远.此外,对我国盾腹属种类的宿主特异性进行了讨论.
作 者：陈明秀 张立强 文春根 孙军 高谦 CHEN Ming-Xiu ZHANG Li-Qiang WEN Chun-Gen SUN Jun GAO Qian 作者单位：陈明秀,CHEN Ming-Xiu(华中农业大学水产学院,武汉,430070;中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072)张立强,高谦,ZHANG Li-Qiang,GAO Qian(中国科学院水生生物研究所,淡水生态与生物技术国家重点实验室,武汉,430072)
文春根,WEN Chun-Gen(南昌大学生命科学学院,南昌,330047)
孙军,SUN Jun(暨南大学水生生物研究所,广州,510632)
刊 名：水生生物学报 ISTIC PKU英文刊名：ACTA HYDROBIOLOGICA SINICA 年，卷(期)： 34(2) 分类号：Q349~+.13 关键词：ITS rDNA 盾腹属 系统发育关系 宿主特异性 ITS rDNA Aspidogaster Phylogenetic relationship Host specificity篇3：基于叶绿体 Trn L-F 序列和联合数据分析木通科的分子系统发育
基于叶绿体 Trn L-F 序列和联合数据分析木通科的分子系统发育
基于叶绿体 trn L-F 序列单独分析以及 trn L-F 和 rbc L 序列联合分析重建了木通科的分子系统发育.本研究的系统发育拓扑结构与覃海宁和塔赫他间的族划分系统非常一致.猫儿屎族和串果藤族在系统发育树上位于本科的基部.由分布于南美的勃奎拉藤属和拉氏藤属组成的拉氏藤族得到了 trn L-F 序列分析(100%)和联合序列分析(99%)的很好支持.木通族在两个分析里都得到了100%的`靴带支持率.新建立的长萼木通属在 trn L-F 树上嵌套在木通属内;然而,在联合分析的树上,它与木通属形成姐妹群并得到很高的支持率.在系统发育上关系密切的3个属: 牛藤果属、八月瓜属和野木瓜属之间的关系仍未解决.牛藤果与八月瓜在两个分析里都形成姐妹群,但支持率低.小花鹰爪枫嵌套在野木瓜属内,并与西南野木瓜形成姐妹群.木通族内这3个属可能都不是单系,它们的属间界限和属的界定需要更多的分子和形态数据的进一步研究.
作 者：王峰 李德铢 杨俊波 WANG Feng LI De-Zhu YANG Jun-bo 作者单位：王峰,WANG Feng(中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学开放实验室,昆明,650204;西北师范大学学报编辑部,兰州,730070)李德铢,杨俊波,LI De-Zhu,YANG Jun-bo(中国科学院昆明植物研究所生物多样性与生物地理学开放实验室,昆明,650204)
刊 名：植物学报 ISTIC SCI英文刊名：ACTA BOTANICA SINICA 年，卷(期)： 44(8) 分类号：Q941+.2 Q949.746.6 关键词：木通科 分子系统发育 trn L-F序列 rbc L序列 Lardizabalaceae molecular phylogeny trn L-F sequences rbc L sequences篇4：斑龙芋属植物的系统发育分析
斑龙芋属植物的系统发育分析
运用分支分类分析方法对斑龙芋属及其近缘属进行系统发育分析,以4个属的15个种作为15个分支分类单位,选择菖蒲科的菖蒲作为外类群,从斑龙芋属植物特征中选取了14个性状作为建立数据矩阵的基本资料,并以外类群比较和通行的形态演化规律,及核型演化规律为依据对这些性状进行极化,采用改进的最大同步法和最小平行法进行分类运算,按照最简约的原则,运用演化长度较短的`最大同步法谱系分支图,作为讨论的基础,讨论了斑龙芋属及其近缘属的系统关系.
作 者：李爱花 王仲朗 管开云 LI Ai-hua WANG Zhong-lang GUAN Kai-yun 作者单位：中国科学院,昆明植物研究所,云南,昆明,650204 刊 名：广西植物 ISTIC PKU英文刊名：GUANGXI ZHIWU 年，卷(期)： 26(3) 分类号：Q949.7 关键词：斑龙芋属 分支分类 系统发育分析篇5：基于rDNA ITS序列分析Alternaria与相似属的关系及A.le
基于rDNA ITS序列分析Alternaria与相似属的关系及A.leucanthemi的分类地位
对Alternaria,Stemphylium,Ulocladium,Nimbya,Embellisia等五个形态相似属的代表性种进行了5.8S/ITS区段序列测定,连同从GenBank下载的相关有性型Pleospora,Lewia的同项资料,由Neighbor-joining方法构建系统发育树.序列对比结果显示,所有参试的'菌株/种的5.8SrDNA序列保守程度较高,ITS序列变化较大,ITS1比ITS2变化更大.由5.8S/ITS构建的系统发育树可以足够将供试菌区分到属;系统发育树显示Alternaria,Ulocladium,Nimbya和Embellisia系统学关系较近,又存在一定的分化;Stemphylium聚在相对较远的分支上,与上述四属关系较远,相对独立进化;有性型的Pleospora与无性型的Stemphylium被聚到一个分支,这种不同阶段菌株在遗传基础上的一致,充分证明所用方法及所选测序的rDNA区段对本类群真菌的分类很有价值.Alternaria leucanthemi位于系统发育树的外侧,较为独立进化,与Alternaria的其它种亲缘关系较远,却与Stemphylium spp.和Bipolaris spp.关系较近,对其目前的分类地位提出质疑.
作 者：赵国柱 张天宇 曹爱新 王洪凯 ZHAO Guo-Zhu ZHANG Tian-Yu CAO Ai-Xin WANG Hong-Kai 作者单位：赵国柱,ZHAO Guo-Zhu(山东农业大学植物病理学系,山东,泰安,271018;中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室,北京,100080)张天宇,王洪凯,ZHANG Tian-Yu,WANG Hong-Kai(山东农业大学植物病理学系,山东,泰安,271018)
曹爱新,CAO Ai-Xin(中国科学院微生物研究所真菌地衣系统学重点实验室,北京,100080)
刊 名：菌物学报 ISTIC PKU英文刊名：MYCOSYSTEMA 年，卷(期)：2006 25(2) 分类号：Q939.5 关键词：链格孢属 匍柄霉属 假格孢属 埃里格孢属 细基格孢属 系统学篇6：中国小蜂科属间系统发育关系分析(膜翅目:小蜂科)
中国小蜂科属间系统发育关系分析(膜翅目:小蜂科)
利用Hennig86程序的nelsen合意和Phylip程序的多数规则合意2种支序分析方法,探讨了中国小蜂科的系统发育关系.基于中国21属的`30个性状,计算得到2个合意树,其分类系统与传统分类系统基本保持一致.在进化关系和亲缘关系上表现为:小蜂属(Chalcis)、卡诺小蜂属(Conura)、大腿小蜂属(Brachymeria)和脊柄小蜂属(Epitranus)相对最为原始,而泰内小蜂属(Tainaniella)和背突小蜂属(Oxycoryphe)相对最为进化,前者和后者之间的亲缘关系最远;亲缘关系最近的有:泰内小蜂属(Tainaniella)和背突小蜂属(Oxycoryphe),泊卡小蜂属(Proconura)和日本小蜂属(Nipponochalcidia),小蜂属(Chalcis)和卡诺小蜂属(Conura)以及细尾小蜂属(Megalocolus)和三角小蜂属(Trigonura),它们分别构成姊妹群关系.
作 者：杨郁霞 刘长明 YANG Yu-xia LIU Chang-ming 作者单位：教育部生物农药与化学生物学重点实验室,福建农林大学,福建,福州,350002 刊 名：昆虫分类学报 ISTIC PKU英文刊名：ENTOMOTAXONOMIA 年，卷(期)： 28(4) 分类号：Q969.54+5.6 关键词：膜翅目 小蜂科 系统发育 支序分析篇7：据叶绿体trnL-F序列分析高等金缕梅类植物的系统发育关系
据叶绿体trnL-F序列分析高等金缕梅类植物的系统发育关系
研究对“高等”金缕梅类的8科24属25种植物和外类群Hamamelis两种植物的叶绿体DNA trnL-F区进行了测序,并根据DNA序列对该类植物的系统发育关系进行了分析.结果表明: 所有“高等”金缕梅类植物的科结合成一支, bootstrap 分析支持率为100%,各科之间的.关系得到很好分辨.Nothofagus是最基部的一支;山毛榉科(Fagaceae)作为姐妹群与“核心”金缕梅类的科(桦木科Betulaceae,胡桃科Juglandaceae, 木麻黄科Casuarinaceae, 杨梅科Myricaceae, Ticodendraceae 和马尾树科Rhoipteleaceae)组成一支,并得到很强的支持.“核心”金缕梅类构成三支,关系如下:(1) Casuarina (Ticodendron, (Betulaceae)), (2) Juglandaceae-Rhoipteleaceae, (3) Myricaceae.本研究显示叶绿体DNA trnL-F区对分辨“高等”金缕梅类科间关系及部分科内的属间关系十分有效.
作 者：李睿琦 陈之端 洪亚平路安民 LI Rui-Qi CHEN Zhi-duan HONG Ya-Ping LU An-Ming 作者单位：中国科学院植物研究所系统与进化植物学重点实验室,北京,100093 刊 名：植物学报 ISTIC SCI英文刊名：ACTA BOTANICA SINICA 年，卷(期)： 44(12) 分类号：Q949 关键词：trnL-F区 叶绿体DNA “高等”金缕梅类 系统发育关系 trnL-F cpDNA “higher” hamamelids familial relationships篇8：我国珠母贝属(Pinctada)主要种类亲缘关系的初步分析
我国珠母贝属(Pinctada)主要种类亲缘关系的初步分析
采用核糖体DNA内部转录间隔子1(ITS 1)序列初步分析了珠母贝属8个种的亲缘关系.结果表明,ITS 1长度范围分布在402-474bp之间,大珠母贝的ITS 1序列最长,黑珠母贝的最短.作为外群的企鹅珍珠贝ITS 1长385bp.系统发育分析表明,所研究种类聚合成3个类群.类群I包括合浦珠母贝Pinctada fucata和覆瓦珠母贝P.imbricata.类群II包括白珠母贝P.albina、黑珠母贝P.nigra、长耳珠母贝P.chemnitzi和射肋珠母贝P.radiata,其中前2个种聚合成1枝,后两个种聚合成另一枝,分别形成两个亚群:类群IIA和类群IIB.类群III包括珠母贝P.margaritifera和大珠母贝P.maxima.类群IIA与类群IIB之间、类群III的'大珠母贝与珠母贝之间的遗传距离较近(0.080- 0.100),类群I与类群II之间遗传距离较远(0.250- 0.270),类群III与类群I和类群II之间的遗传距离最大(0.400- 0.570).类群I中我国的P.fucata和澳大利亚的P.imbricata之间遗传距离很小(0.000-0.013),而两者的种内遗传距离分别为0.002- 0.013和0.005,种内与种间遗传距离相重叠,表明P.fucata和P.imbricata应为同种.类群IIA的P.albina与P.nigra之间的遗传距离为0.013,可能为两个亚种.类群IIB中的P.radiata与P.chemnitzi之间的遗传距离只有0.005-0.007,而本研究的P.chemnitzi的ITS 1序列与GenBank中的P.chemnitzi的ITS 1序列高度一致,表明P.radiata的鉴别可能有误.
作 者：喻达辉 朱嘉濠 贾晓平YU Da-Hui CHU Ka-Hou JIA Xiao-Ping 作者单位：喻达辉,YU Da-Hui(中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300;香港中文大学生物系李福善海洋科学研究中心,沙田,香港)朱嘉濠,CHU Ka-Hou(香港中文大学生物系李福善海洋科学研究中心,沙田,香港)
贾晓平,JIA Xiao-Ping(中国水产科学研究院南海水产研究所,广州,510300)
刊 名：海洋与湖沼 ISTIC PKU英文刊名：OCEANOLOGIA ET LIMNOLOGIA SINICA 年，卷(期)： 37(3) 分类号：Q179.4 关键词：珠母贝属 内部转录间隔子 系统发育分析 亲缘关系篇9：叶甲科部分种类 Cyt b基因序列及系统发育关系初探
叶甲科部分种类 Cyt b基因序列及系统发育关系初探
测定分析了叶甲科 (Chrysomelidae)15 种昆虫mtDNA_Cyt b基因部分序列,结果显示,在获得的390 bp序列中,198个核苷酸位点为多态性位点(约占50.8%),序列间碱基差异平均值为18.9%,A+T含量为72.7%,碱基转换呈现明显的TC偏向性,颠换主要以TA为主,转换/颠换(R)值为0.8.依据分子数据建立了该 15种昆虫的系统发育关系,结果表明:跳甲亚科(Alticinae)和叶甲亚科(Chrysomelinae)的亲缘关系较近,萤叶甲亚科(Galerucinae)与前两者的关系较远.萤叶甲亚科中瓢萤叶甲为最早分化的类群,长跗萤叶甲属(Monolepta)、凹翅萤叶甲属(Paleosepharia)、长刺萤叶甲属(Atrachya)能形成姊妹群.克萤叶甲属(Cneorane)和守瓜属(Aulacophora)的亲缘关系较近.基于蛋白质序列构建的.系统树的置信值高于核苷酸序列建立的系统发育树.
作 者：方雪梅 聂晓萌 黄菲 郑哲民 FANG Xue-mei NIE Xiao-meng HUANG Fei ZHENG Zhe-min 作者单位：方雪梅,FANG Xue-mei(宿州学院,生化系,安徽,宿州,234000;陕西师范大学,动物研究所,陕西,西安,710062)聂晓萌,黄菲,郑哲民,NIE Xiao-meng,HUANG Fei,ZHENG Zhe-min(陕西师范大学,动物研究所,陕西,西安,710062)
刊 名：华北农学报 ISTIC PKU英文刊名：ACTA AGRICULTURAE BOREALI-SINICA 年，卷(期)：2006 21(6) 分类号：Q969 关键词：鞘翅目 叶甲科 mtDNA-Cyt b 系统发育关系★ 游花卉市场作文
★ 小苍兰的花语含义
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