10个牛品种线粒体12S rRNA基因多态性分析

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10个牛品种线粒体12S rRNA基因多态性分析

篇1:10个牛品种线粒体12S rRNA基因多态性分析

10个牛品种线粒体12S rRNA基因多态性分析

以鲁西牛、渤海黑牛、大别山牛、南阳牛、晋南牛、秦川牛、中国西门塔尔牛、日本和牛、海福特牛和安格斯牛10个牛品种共计353头牛为研究对象,利用单链构象多态性(SSCP)分子标记方法对其线粒体DNA 12S rRNA基因进行了多态性分析,结果发现该基因出现分布频率不同的`3种单倍型(Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ),其中单倍型Ⅰ出现的频率最低,仅在晋南牛1个个体中发现;单倍型Ⅱ在中国本地黄牛中都存在,在中国西门塔尔牛中的分布频率很低,但在3个国外品种海福特牛、安格斯牛和日本和牛中不存在;单倍型Ⅲ在这10个牛品种中均有分布,但以国外品种最丰富.计算平均多态信息含量,发现我国地方品种在0.232~0.423之间,基本属于中度多态,说明我国地方黄牛品种在12S rRNA上多态性比较丰富,国外品种较为贫乏;但是单倍型Ⅰ频率很低有丢失的趋势,需要对其进行保护.

作 者:孟彦 许尚忠 昝林森 高雪 陈金宝 任红 王兴平MENG Yan XU Shang-Zhong ZAN Lin-Sen GAO Xue CHEN Jin-Bao REN Hong-Yan WANG Xing-Ping  作者单位:孟彦,许尚忠,王兴平,MENG Yan,XU Shang-Zhong,WANG Xing-Ping(西北农林科技大学动科学院,杨凌,712100;中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094)

昝林森,ZAN Lin-Sen(西北农林科技大学动科学院,杨凌,712100)

高雪,陈金宝,任红,GAO Xue,CHEN Jin-Bao,REN Hong-Yan(中国农业科学院畜牧研究所,北京,100094)

刊 名:遗传  ISTIC PKU英文刊名:HEREDITAS(BEIJING) 年,卷(期): 28(4) 分类号:Q953 关键词:牛   线粒体DNA   12S rRNA基因   SSCP   多态性牛   线粒体DNA   12S rRNA基因   SSCP   多态性  

篇2:马鹿线粒体DNA序列多态性分析

马鹿线粒体DNA序列多态性分析

采用聚合酶链式反应(PCR)技术对40只马鹿mtDNA细胞色素b序列进行扩增,对所得PCR产物测序,测得405 bp的核甘酸片段序列,统计分析了6个品种或类型间的遗传关系,通过遗传关系建立了系统发育树.结果表明:天山马鹿和东北马鹿的亲缘关系较近,塔里木马鹿同天山马鹿、阿尔泰马鹿、甘肃马鹿、东北马鹿、左家马鹿的'亲缘关系较远,塔里木马鹿和天山马鹿的亲缘关系最远.将6个马鹿品种(或类型)重新划分为4大类群:东北马鹿和左家马鹿为一类,天山马鹿和阿尔泰马鹿为一类,塔里木马鹿为一类,甘肃马鹿为一类.

作 者:邢秀梅 杨福合 苏伟林 李一清 XING Xiu-mei YANG Fu-he SU Wei-lin LI Yi-qing  作者单位:中国农业科学院特产研究所,吉林,132109 刊 名:吉林农业大学学报  ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF JILIN AGRICULTURAL UNIVERSITY 年,卷(期):2006 28(3) 分类号:Q959.842 关键词:马鹿   mtDNA   遗传多样性  

篇3:节肢动物线粒体基因组研究进展与基因顺序分析

节肢动物线粒体基因组研究进展与基因顺序分析

在总结了68种节肢动物线粒体基因组的测序种类、基因组组成、结构及基因排序情况的.基础上,特别对节肢动物线粒体基因组基因排列顺序数据进行了详细的分析.线粒体基因组基因排列顺序数据显示六足动物与甲壳动物之间相似,螯肢动物与多足动物相似,这个结果和以前Boore对节肢动物线粒体基因组顺序分析结果不同, 却和核rRNA数据的分析结果一致.

作 者:胡婧 刘念 黄原 HU Jing LIU Nian HUANG Yuan  作者单位:陕西师范大学生命科学学院,陕西,西安,710062 刊 名:昆虫分类学报  ISTIC PKU英文刊名:ENTOMOTAXONOMIA 年,卷(期): 28(2) 分类号:Q959.22 关键词:节肢动物   线粒体基因组   基因顺序   系统发育  

篇4:10种石斑鱼系统发育的线粒体细胞色素b基因序列分析

10种石斑鱼系统发育的线粒体细胞色素b基因序列分析

为探讨石斑鱼亚科鱼类的系统发育关系,测定了此亚科中具有代表性的石斑鱼属、鳃棘鲈属、九棘鲈属、驼背鲈属和白线光腭鲈属等5个属10种石斑鱼的细胞色素b基因全序列,分析了这些序列的'特性,运用Kimura 2-parameter模型,以邻接法构建了分子系统树.结果表明,九棘鲈属与鳃棘鲈属位于系统进化树的基部,与石斑鱼类其它类群亲缘关系较远;驼背鲈属与白线光腭鲈属网结于石斑鱼属构成的分支中.

作 者:陈艺燕 章群 任岗 钱开诚 陈迪 许忠能 CHEN Yi-yan ZHANG Qun REN Gang QIAN Kai-cheng CHEN Di XU Zhong-neng  作者单位:暨南大学,水生生物研究所,广东,广州,510632 刊 名:海洋科学  ISTIC PKU英文刊名:MARINE SCIENCES 年,卷(期):2006 30(6) 分类号:Q959.483 关键词:石斑鱼类   细胞色素b基因   分子系统学  

篇5:贵州瑶族3支系Y-DNA及线粒体DNA序列多态性分析

贵州瑶族3支系Y-DNA及线粒体DNA序列多态性分析

采用PCR-RFLP技术,通过观察由12个单核苷酸多态位点(SNPs)组成的.Y染色体单倍型及由9个多态位点组成的线粒体DNA单倍型在贵州瑶族中的分布,分析贵州瑶族父系及母系遗传结构,探讨其起源及迁徙.结果显示,97份男性样本分别属于H7、H8、H9、H114种Y-DNA单倍型,苗瑶语系特异Y-DNA单倍型H7的平均频率为92.4%;通过对线粒体DNA基因分型,得到8种单倍型,可归入B4、B5、D4、D5和N*单倍型类群中,CoⅡ/tRNALys区域间的9 bp缺失平均频率为58.2%.结果提示贵州瑶族父系遗传结构单一,具有典型的苗瑶族群特征,又存在与其他族群的融合.母系遗传结构相对复杂,9bp缺失是贵州瑶族的母系遗传结构特征.

作 者:褚迅 单可人 文波 齐晓岚 李毅 吴昌学 刘@ 赵艳 任锡麟 金力 CHU Xun SHAN Ke-Ren WEN Bo QI Xiao-Lan LI Yi WU Chang-Xue LIU Xuan ZHAO Yan REN Xi-Lin JIN Li  作者单位:褚迅,单可人,齐晓岚,李毅,吴昌学,刘@,赵艳,任锡麟,CHU Xun,SHAN Ke-Ren,QI Xiao-Lan,LI Yi,WU Chang-Xue,LIU Xuan,ZHAO Yan,REN Xi-Lin(贵阳医学院分子生物学重点实验室,贵阳,550004)

文波,金力,WEN Bo,JIN Li(复旦大学生命科学院现代人类学研究中心,上海,33)

刊 名:遗传  ISTIC PKU英文刊名:HEREDITAS(BEIJING) 年,卷(期): 28(2) 分类号:Q987 关键词:贵州瑶族   Y-DNA单倍型   mtDNA单倍型类群  

篇6:内蒙古砧子山墓地古人的线粒体DNA多态性分析

内蒙古砧子山墓地古人的线粒体DNA多态性分析

为了研究内蒙古元上都遗址砧子山墓地古代人群的遗传结构及其可能来源,对该墓地古人的DNA进行了抽提、扩增和测序,获得了10个个体的线粒体DNA高可变一区序列.结合现代东亚、北亚、中亚和欧洲人的'线粒体DNA数据进行了系统发育分析和多维尺度分析.研究结果表明:埋藏在砧子山墓地的元代居民为汉族人,主要是来自中国北方地区的汉族.本研究为揭示元代的复杂社会结构和人群历史动态提供了新的方法.

作 者:付玉芹 许雪莲 王海晶 谢承志 周慧 朱泓 FU Yu-qin XU Xue-lian WANG Hai-jing XIE Cheng-zhi ZHOU Hui ZHU Hong  作者单位:付玉芹,周慧,FU Yu-qin,ZHOU Hui(吉林大学边疆考古研究中心考古DNA实验室,吉林,长春,130023;吉林大学生命科学学院,吉林,长春,130023)

许雪莲,王海晶,谢承志,XU Xue-lian,WANG Hai-jing,XIE Cheng-zhi(吉林大学生命科学学院,吉林,长春,130023)

朱泓,ZHU Hong(吉林大学边疆考古研究中心考古DNA实验室,吉林,长春,130023)

刊 名:东北师大学报(自然科学版)  ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF NORTHEAST NORMAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE EDITION) 年,卷(期):2006 38(2) 分类号:Q987 关键词:线粒体DNA   古DNA   统计学分析  

篇7:中国北方汉族人群sTnT基因单核苷酸多态性分析

中国北方汉族人群sTnT基因单核苷酸多态性分析

目的:研究中国北方汉族人群sTnT基因的单核苷酸多态性(SNP),观察其在北方汉族人群中的分布.方法:用PCR-RFLP的方法对204名中国北方汉族人群sTnT基因的SNP进行分析,确定其等位基因频率.结果:美国国立生物技术信息中心报告的外显子11上的'27916722 A/C未在本项研究人群中检测到.27930097 C/G和的27920978 C/T的等位基因频率与美国国立生物技术信息中心(NCBI)报道均有显著性差异.结论:sTnT基因SNP分布具有种族差异性.

作 者:许春艳 胡扬 刘海平XU Chun-yan HU Yang LIU Hai-ping  作者单位:许春艳,胡扬,XU Chun-yan,HU Yang(北京体育大学,运动生化教研室,北京,1000842)

刘海平,LIU Hai-ping(温州医学院,体育部,温州,325035)

刊 名:中国应用生理学杂志  ISTIC PKU英文刊名:CHINESE JOURNAL OF APPLIED PHYSIOLOGY 年,卷(期): 22(4) 分类号:Q445 关键词:慢型肌钙蛋白T(sTnT)   单核苷酸多态性   中国北方汉族人群  

篇8:牛γ-干扰素基因的克隆及序列分析

牛γ-干扰素基因的克隆及序列分析

根据GenBank中已公布的.牛γ-干扰素(BovIFN-γ)基因序列设计引物,应用一步法逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,以从牛外周血淋巴细胞提取的总RNA为模板,扩增出γ-干扰素成熟肽基因片断,并对其进行了克隆、测序及序列分析.结果表明,试验所设计引物可以成功用于扩增牛γ-干扰素成熟肽基因片段,所扩增序列与GenBank中已有序列同源性达99.77%.

作 者:武玉梅 郝永清 张爱荣 史冬艳 WU Yu-mei HAO Yong-qing ZHANG Ai-rong SHI Dong-yan  作者单位:内蒙古农业大学动物科学与医学学院,内蒙古,呼和浩特,010018 刊 名:畜牧与饲料科学 英文刊名:ANIMAL HUSBANDRY AND FEED SCIENCE 年,卷(期): 30(3) 分类号:Q78 关键词:牛γ-干扰素   RT-PCR法   克隆   序列分析  

篇9:刀鲚与湖鲚线粒体细胞色素b基因片段多态性及遗传关系

刀鲚与湖鲚线粒体细胞色素b基因片段多态性及遗传关系

使用线粒体细胞色素b基因片段序列为分子标记,分析了刀鲚和湖鲚的遗传多态性及遗传关系.在两个群体中共检测到5种不同的单倍型.刀鲚和湖鲚的'单倍型多样性指数分别为0.9000和0.7000;核苷酸多样性指数分别为0.3763%和0.4301%.分子方差分析显示两者遗传分化的水平很低,群体间的差异对总的变异没有贡献.所以认为它们之间的差异尚未达到亚种水平,这一结果支持湖鲚是刀鲚的一个地理种群的观点.

作 者:程起群 温俊娥 王云龙 韩金娣 卢大儒 CHENG Qiqun WEN June WANG Yunlong HAN Jindi LU Daru  作者单位:程起群,CHENG Qiqun(农业部海洋与河口渔业重点实验室,中国水产科学研究院东海水产研究所,上海,200090;复旦大学遗传学研究所,遗传工程国家重点实验室,上海,200433)

温俊娥,WEN June(上海复生生物工程研究所,上海,200433)

王云龙,韩金娣,WANG Yunlong,HAN Jindi(农业部海洋与河口渔业重点实验室,中国水产科学研究院东海水产研究所,上海,200090)

卢大儒,LU Daru(复旦大学遗传学研究所,遗传工程国家重点实验室,上海,200433)

刊 名:湖泊科学  ISTIC PKU英文刊名:JOURNAL OF LAKE SCIENCES 年,卷(期):2006 18(4) 分类号:Q95 关键词:刀鲚   湖鲚   细胞色素b   遗传多样性   遗传差异   进化  

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