枫香ISSR-PCR扩增条件的优化(（精选9篇））由网友“春天里的彩虹”投稿提供，以下是小编整理过的枫香ISSR-PCR扩增条件的优化，欢迎阅读分享，希望对您有所帮助。
篇1：枫香ISSR-PCR扩增条件的优化
枫香ISSR-PCR扩增条件的优化
对浙江省天台山枫香自然种群的'DNA进行提取和ISSR-PCR扩增条件的优化.分析了Mg2+浓度、4×dNTP浓度、BSA浓度、模板DNA用量、引物用量、Taq DNA聚合酶用量等对反应结果的影响.建立了适用于枫香ISSR分析最适宜的反应体系:10 μl PCR反应体积中,1 × Taq酶配套缓冲液(10 mmol・L-1 Tris-HCl,pH值9.0,50 mmol・L-1 KCl,0.1%TritonX-100),2.0 mmol・L-1 Mg2+,0.15 mmol・L-1 4×dNTP,2 mg・mL-1 BSA,10 ng模板DNA,6 pmol引物,0.9 U Taq DNA聚合酶,引物UBC808的最适退火温度为52.4℃.用此反应体系对天台山枫香自然种群进行了遗传多样性分析,结果显示其多态位点百分率为84.26%,Nei指数为0.2665,Shannon信息指数为0.4044,其遗传多样性处于较高水平.
作 者：毕泉鑫 金则新 曾志成 叶文国 李建辉 BI Quan-xin JIN Ze-xin ZENG Zhi-cheng YE Wen-guo LI Jian-hui 作者单位：毕泉鑫,金则新,曾志成,李建辉,BI Quan-xin,JIN Ze-xin,ZENG Zhi-cheng,LI Jian-hui(台州学院生态研究所,浙江,临海,317000)叶文国,YE Wen-guo(天台县林业局,浙江,天台,317200)
刊 名：福建林业科技 PKU英文刊名：JOURNAL OF FUJIAN FORESTRY SCIENCE AND TECHNOLOGY 年，卷(期)： 35(1) 分类号：Q943 关键词：枫香 ISSR 优化 遗传多样性篇2：荔枝DNA提取及RAPD扩增条件优化
荔枝DNA提取及RAPD扩增条件优化
为应用RAPD技术开展对荔枝种质资源的分析,以S43(GTCGCCGTCA)为引物,通过试验设计,分别研究了退火温度、模板浓度、引物浓度、dNTP浓度、Taq DNA聚合酶用量对荔枝RAPD-PCR反应的'影响. 建立并优化了适宜荔枝RAPD分析的扩增体系:20 μL的反应体系,30 ng的模板DNA度,0.25 μmol/L RAPD引物、1.0 U Taq DNA聚合酶,0.2 μmol/L dNTP为荔枝适宜的RAPD-PCR扩增条件.
作 者：尤有利 王江波 施维属 潘东明 作者单位：尤有利(福建永春县农业技术推广站,泉州,362600)王江波,施维属,潘东明(福建农林大学园艺学院,福建农林大学园艺产品贮运保鲜研究所,福州,350002)
刊 名：生物技术通报 PKU英文刊名：BIOTECHNOLOGY BULLETIN 年，卷(期)： “”(4) 分类号： 关键词：荔枝 RAPD 优化 PCR Litchi chinensis Sonn. RAPD Optimize PCR篇3：扩增香螺SSR指纹研究的试验条件的优化
扩增香螺SSR指纹研究的试验条件的优化
利用SSR技术对香螺进行了PCR扩增,探索香螺基因组DNA的提取方法.从香螺23对近缘种引物中筛选出8对可以扩增的引物,对引物浓度、Taq酶浓度、循环次数、模板浓度等方面进行了研究,从而探索出一个适合香螺SSR分析的.反应体系和反应条件并对微卫星引物通用性进行初步分析.
作 者：隋娜 侯林 董长勇 李妍 王明昌 张筠 SUI Na HOU Lin DONG Chang-yong LI Yan WANG Ming-chang ZHANG Yun 作者单位：辽宁师范大学,生命科学学院,辽宁,大连,116029 刊 名：水产科学 PKU英文刊名：FISHERIES SCIENCE 年，卷(期)： 27(4) 分类号：Q25 关键词：香螺 SSR 条件优化篇4：日本沼虾基因片段PCR扩增的条件优化
日本沼虾基因片段PCR扩增的条件优化
以日本沼虾肌肉组织为材料,提取其基因组DNA,研究了该虾16S rRNA基因片段扩增的PCR反应条件.经对扩增反应体系中各因子和扩增程序的'梯度实验,确定优化反应条件为:在25 μL反应体系中,10×Buffer 2.5μL,DNA模板200～300 ng,4×dNTP 0.2 mmol/L,Mg2+1.5 mmol/L,引物0.4 μmol/L,Taq DNA聚合酶1 U,95℃预变性5 min;接着35个循环包括95℃变性1 min,56 ℃复性50 s,72℃延伸1 min;最后72℃延伸10 min.应用此优化体系扩增日本沼虾18S rRNA,细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidase subunit I,COI),NADH脱氢酶亚基V(NADH dehydrogenase subunit 5,ND5)等基因片段均获得了稳定而理想的效果.研究结果为深入探讨日本沼虾种群的遗传和变异,以及开展其种质鉴定和分子标记等研究提供了参考.
作 者：赵晓勤 倪娟 陈立侨 顾志敏 周志明 ZHAO Xiao-qin NI Juan CHEN Li-qiao GU Zhi-min ZHOU Zhi-ming 作者单位：赵晓勤,倪娟,陈立侨,ZHAO Xiao-qin,NI Juan,CHEN Li-qiao(华东师范大学,生命科学学院,上海,62)顾志敏,周志明,GU Zhi-min,ZHOU Zhi-ming(浙江省淡水水产研究所,浙江,313001)
刊 名：华东师范大学学报（自然科学版） ISTIC PKU英文刊名：JOURNAL OF EAST CHINA NORMAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE) 年，卷(期)： “”(2) 分类号：Q503 关键词：日本沼虾 PCR 优化篇5：牡丹ISSR-PCR反应体系正交优化设计
牡丹ISSR-PCR反应体系正交优化设计
以“凤丹”(Paeonia ostii)基因组DNA为模板,采用正交试验设计方法,研究牡丹ISSR反应体系的影响因素,建立了适合牡丹的'ISSR反应体系及程序.10μl反应体系为:1×反应缓冲液,2.5 mmol/L M2+,0.4 mmol/L dNTPs,1.0 U Taq聚合酶,0.75μmol/L引物,10～20 ng模板DNA.反应程序为:94℃预变性3 min;94℃变性45 s,45～60℃(不同引物退火温度各异)复性45 s,72℃延伸90 s,35个循环;72℃延伸7 min;4℃保存.通过梯度退火试验,确定不同引物的退火温度.
作 者：王佳 胡永红 张启翔 作者单位：王佳,张启翔(北京林业大学,北京,100083)胡永红(上海植物园,上海,31)
刊 名：安徽农业科学 ISTIC PKU英文刊名：JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES 年，卷(期)：2006 34(24) 分类号：Q946-33 关键词：牡丹 ISSR-PCR 正交设计 反应体系篇6：鹧鸪茶ISSR-PCR反应体系优化的研究
鹧鸪茶ISSR-PCR反应体系优化的研究
通过单因素试验研究了大戟科野桐属植物鹧鸪茶ISSR-PCR反应体系中的主要影响因子.经过优化实验,建立了一套稳定的鹧鸪茶ISSR-PCR反应体系:10×buffer 2.5μL,1.5～3.0 mmol・L-1MgCl2,50～300 μmol・L-1dNTPs,Taq酶2.5～3.0U,引物0.3～0.6μmol・L-1,DNA模板80～160 ng.最后用无菌超纯水补足至25μL.PCR扩增程序为:94℃预变性4 min,然后按94℃变性40 s.52～54℃退火45 s,72℃延伸120 S,进行40个循环,最后72℃延伸8 min:16℃保存.该反应条件可应用于鹧鸪茶不同居群间亲缘关系和遗传多样性分析.
作 者：李娟玲 刘国民 贾媛 LI Juanling LIU Guomin JIA Yuan 作者单位：李娟玲,刘国民,LI Juanling,LIU Guomin(海南大学,热带生物资源教育部重点实验室,海南,海口570228;海南大学,苦丁茶研究所,海南,海口570228)贾媛,JIA Yuan(海南大学,苦丁茶研究所,海南,海口570228)
刊 名：海南师范大学学报（自然科学版） 英文刊名：JOURNAL OF HAINAN NORMAL UNIVERSITY(NATURAL SCIENCE) 年，卷(期)： 22(2) 分类号：Q943 关键词：鹧鸪荼 ISSR 影响因子 体系优化篇7：甜槠ISSR-PCR反应体系的正交优化
甜槠ISSR-PCR反应体系的正交优化
对甜槠Castanopsis eyrei进行遗传多样性研究的过程中,为了获得清晰可靠、重复性强的ISSR扩增结果,利用正交设计对Mg2+,dNTP,引物,Taq酶,牛血清蛋白(BSA)和模板DNA等6种因素5个水平进行筛选和优化.确定甜槠ISSR-PCR最适宜反应体系为:10 μL反应体积中,1×Taq酶配套缓冲液(10 mmol・L-1 Tris-HCl,pH 9.0,50 mmol・L-1 KCl,10 g・L-1 TritonX-100),1.7 mmol・L-1Mg2+,0.25 mmol・L-1 dNTP,8.34 nkat TaqDNA 聚合酶,1.5 g・L-1牛血清白蛋白,6 pmol引物,12 ng模板DNA.甜槠扩增时引物UBC846的'最适退火温度为56.3 ℃.图2表1参23
作 者：张文标 金则新 李钧敏 潘冠琼 ZHANG Wen-biao JIN Ze-xin LI Jun-min PAN Guan-qiong 作者单位：张文标,ZHANG Wen-biao(西南师范大学,三峡库区生态环境教育部重点实验室,重庆,400715;台州学院,生态研究所,浙江,临海,317000)金则新,李钧敏,潘冠琼,JIN Ze-xin,LI Jun-min,PAN Guan-qiong(台州学院,生态研究所,浙江,临海,317000)
刊 名：浙江林学院学报 ISTIC PKU英文刊名：JOURNAL OF ZHEJIANG FORESTRY COLLEGE 年，卷(期)： 23(5) 分类号：Q946 S792.17 关键词：植物学 ISSR-PCR 正交设计 优化 甜槠篇8：百里香属植物ISSR-PCR和SRAP-PCR 体系的确立及优化
百里香属植物ISSR-PCR和SRAP-PCR 体系的确立及优化
通过对 PCR 扩增体系中的模板 DNA 用量,Mg2+、dNTPs和引物浓度的'单因子实验,分别建立了适合百里香属(Thymus L.)植物总 DNA 的 ISSR-PCR 及 SRAP-PCR 优化反应体系.ISSR-PCR 优化反应体系为:反应总体积20μL,含模板DNA 30 ng、Mg2+ 3.75 mmol・L-1、dNTPs 0.20 mmol・L-1、引物0.3 mmol・L-1和Taq DNA 聚合酶1 U.SRAP-PCR 优化反应体系为:反应总体积20μL,含模板DNA 30 ng、Mg2+ 2.50 mmol・L-1、dNTPs 0.10mmol・L-1、引物0.4 mmol・L-1和 Taq DNA 聚合酶l U.运用优化的反应体系对百里香属植物地椒(T. quinque-costatus Celak.)、地椒的亚洲变种[T. quinquecostatus var.asiaticus(Kitagawa)C.Y.Wu et Y.C.Huang]和百里香(T. mongolicus Ronn.)15个居群的总DNA进行了ISSR和SRAP初步分析,获得了较好的扩增结果.
作 者：权俊萍 袁菊红 穆红梅 张明霞 李乃伟 夏冰 QUAN Jun-ping YUAN Ju-hong MU Hong-mei ZHANG Ming-xia LI Nai-wei XIA Bing 作者单位：权俊萍,QUAN Jun-ping(石河子大学农学院,新疆,石河子,83;江苏省・中国科学院植物研究所,江苏,南京,210014)袁菊红,YUAN Ju-hong(江苏省・中国科学院植物研究所,江苏,南京,210014;江西财经大学资源与环境管理学院,江西,南昌,330032)
穆红梅,张明霞,李乃伟,夏冰,MU Hong-mei,ZHANG Ming-xia,LI Nai-wei,XIA Bing(江苏省・中国科学院植物研究所,江苏,南京,210014)
刊 名：植物资源与环境学报 ISTIC英文刊名：JOURNAL OF PLANT RESOURCES AND ENVIRONMENT 年，卷(期)： 17(2) 分类号：Q946-33 Q523+.8 关键词：百里香属 ISSR-PCR SRAP-PCR 优化反应体系篇9：正交优化法建立沙打旺ISSR-PCR最佳反应体系
正交优化法建立沙打旺ISSR-PCR最佳反应体系
根据正交试验设计的原理,设计了探索性正交试验和细调性正交试验来确定沙打旺ISSR-PCR体系中各成分的浓度.得到既稳定又能扩出最多条带的`适合沙打旺的ISSR-PCR最佳反应体系,即20 μl的反应体系中含有1×buffer,dNTP 0.2 mmol/L,Taq酶1.0 U,引物0.3 μmol/L,Mg2+2.5 mmol/L,DNA模板2.5 ng/μl.然后对沙打旺ISSR-PCR最佳反应体系进行梯度退火试验,得到这条引物的最佳退火温度为54.1 ℃.这一最佳体系的建立为今后利用ISSR标记技术,研究沙打旺的遗传多样性提供了标准化程序.
作 者：陈志宏 黄琳凯 张新全 王志刚 作者单位：陈志宏,王志刚(全国畜牧兽医总站畜禽牧草种质资源保存利用中心,北京,100094)黄琳凯,张新全(四川农业大学动物科技学院草业科学系,四川雅安,625014)
刊 名：安徽农业科学 ISTIC PKU英文刊名：JOURNAL OF ANHUI AGRICULTURAL SCIENCES 年，卷(期)：2006 34(13) 分类号：Q946-33 关键词：沙打旺 ISSR 正交优化 反应体系★ 农村教育调查报告
★ 技术报告范文
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